[图]科学家成功在1.4万年前的狼标本上找到并测序RNA

Credit: Northeastern Federal University

DNA是遗传信息长期储存在生物体中的地方,科学家们正在将其作为一种数据存储系统进行研究,它可以远远超过传统的光盘和磁力驱动器。但RNA是基因的“工作副本”,因此它的存在时间非常短,甚至可能短至2分钟。因此此前科学家认为从古代系统中提取RNA的“转录组”几乎是不可能的。

不过此前也有例外发生。此前可以测序和验证的最古老RNA是700年前的玉米,而最老的已经恢复但不能测序的来自5000岁的蒂罗尔冰人。而现在来自哥本哈根大学,蒂宾根大学,东北联邦大学和比利时皇家自然科学研究所的研究人员发现了一个更古老的样本。

这个样本来自于一个绰号为Tumat Puppy的标本,它是更新世(Pleistocene)时期狼或狗的木乃伊遗骸,可追溯到大约14,300年前。该团队分离并分析了从动物肝脏组织中提取的RNA,并将其与来自19世纪和20世纪的两个更近期的狼样本的组织进行了比较。

该团队成功测序了老年动物的RNA,并通过将其与来自更现代的狼的肝脏特异性转录本相匹配,证实它代表了该生物的RNA整体。这使得这是有史以来最早的转录组测序,至少有13,000年。

该论文的第一作者奥利弗·史密斯(Oliver Smith)表示:

古代DNA研究人员以前不愿意尝试对古老的RNA进行测序,因为它通常比DNA更不稳定,更容易发生酶促降解。然而在我们最近在从植物材料中成功测序古代RNA之后,我们推测在冻结在永久冻土中、保存完好的动物标本同样可能保留足够的材料来排序。令我们高兴的是,我们发现我们不仅找到了来自各种组织的RNA,我们可以用一种具有生物意义的方式区分组织。

这篇论文发表在《PLOS Biology》上。

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